Η υπουργός Εξωτερικών Ντόρα Μπακογιάννη έκανε την ακόλουθη δήλωση για το θάνατο του Μιχάλη Παπαγιαννάκη :

«Με θλίψη πληροφορήθηκα τον θάνατο του φίλου Μιχάλη Παπαγιαννάκη. Ενός ασυμβίβαστου ανθρώπου που έδωσε μάχες για τις ιδέες του. Ο Μιχάλης Παπαγιαννάκης ήταν ένας πολιτικός με αυθεντικά ευρωπαϊκή ταυτότητα και διακρινόταν για το σπάνιο ήθος του που τον οδήγησε να έχει μόνο φίλους σε όλο το φάσμα του πολιτικού κόσμου. Εκφράζω τα θερμά μου συλλυπητήρια στους οικείους του.»